操作系统的升级和发展是影响GIS软件发展的重要因素。早期的GIS软件几乎都基于Unix操作系统，随着个人电脑(PC)快速发展和普及，到二十世纪九十年代后期，Windows成为PC主流操作平台，那些成功地把软件转移到Windows操作系统的GIS厂商得以生存下来。直到目前为止，Windows仍然垄断着PC或客户端操作系统市场。

在服务器端，GIS软件的运行环境变得复杂多样。尽管从2005年开始，Windows已经超过Unix成为第一大服务器端操作系统，但Unix的份额还是非常巨大（如图1）；Linux的销售收入尽管只占11.7%的份额，但Linux价格低廉，若换算成装机数量，Linux所占的份额会大幅度提高。因此，服务器端操作系统基本上处于Windows, Unix和Linux三足鼎立的局面。

2005年全球服务器端操作系统市场份额
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图1. 2005年全球服务器端操作系统市场份额(按销售收入)

自九十年代中以来，国际上主流的GIS厂商把新的主流产品线转移到Windows上来，如ArcGIS 8 、GeoMedia等新一代GIS产品线系列都基于Windows构建。但显然他们在二十一世纪初看到了服务器端操作系统多样化的趋势，近年来出现了向 Unix/Linux回流的趋势。比如，2005年，ESRI实现了主流产品ArcEngine、ArcGIS Server对Unix/Linux的支持，而在此之前，他们仅支持Windows操作系统。Intergraph目前还没有发布同时支持多种操作系统的新GeoMedia平台，但真正关注服务器端市场的GIS厂商都不能忽视服务器端操作系统多元化的状况。

“十五”前期，我国的GIS软件平台主要基于Windows操作系统开发。但也有一些跨平台产品，如吉奥的WebGIS平台—GeoSurf和中遥地网的WebGIS平台—GeoBeans支持多种操作系统，超图的空间数据库平台—SuperMap SDX+ 也支持多种服务器端操作系统。但总体上，还是缺少同时支持Windows、Unix和Linux操作系统的完整的国产GIS产品线。

我国专家已经注意到了服务器端GIS市场，“十五”期间科技部启动了863项目--“面向网络海量空间信息大型GIS”，最终支持了两个GIS通用平台厂商（超图和中地）和一个电力GIS专业平台厂商（雅都）研发基于Unix操作系统的大型GIS。

超图公司在2005年9月发布了支持多种操作系统、多种开发语言、多种组件模型的共相式GIS(Universal GIS)架构，并推出了基于该架构的共相式GIS内核—SuperMap UGC，随后陆续推出了组件式GIS—SuperMap Objects Java和SuperMap Objects .NET，Internet GIS—SuperMap IS Java和SuperMap IS .NET，与SuperMap SDX+一起，形成了支持Windows, Unix和Linux等多种操作系统的完整产品线。但相信不久的将来，其他等厂商也会逐步建立跨平台的全系列服务端GIS产品线。